آيت ا... مرتضي اشرفي شاهرودي می گفتند: در ايام فروردين امسال که به عتبات عاليات مشرف شده بودم، در نجف اشرف، جلسه 45 دقيقهاي خصوصي با آيتا... العظمی سيستاني داشتم. اين مرجع معظم تقليد، در اين جلسه گفتند:« احاطه و اشراف من به قضاياي ايران، از شما هم بيشتر است.»
ايشان بر اين نکته هم تأکيد داشتند که در شرايط کنوني، شيعه، دشمنان فراواني دارد و آنها از قدرت شيعه، به شدت در هراس هستند. ايران، يگانه مملکت داراي حکومت اسلامي است و لذا همه بايد در جهت تقويت اين نظام اسلامي تلاش کنيم. نسبت به ايران و قضاياي کشور، انتقاداتی هم دارم؛ اما نگران آن هستم که با بيان اين انتقادها، نظام جمهوري اسلامي تضعيف شود و بنده در اين باره عندا... مسئول ميباشم و لذا حتي کلمهاي در جهت تضعيف نظام اسلامي ايران بر زبان نخواهم راند.