سرلشکر پاسدار سید یحیی صفوی می‌گوید:

در آغاز جنگ تحمیلی، آیت‌الله خامنه‌ای با دکتر چمران در ستاد جنگ‌های نامنظم فعالیت میکردند. ایشان در آن زمان، هم امام جمعه تهران، هم نماینده حضرت امام در شورای عالی دفاع و هم نماینده مردم تهران در مجلس شورای اسلامی بودند. چنین شخصی با این مسئولیت‌ها، مانند یک بسیجی خاکی در جبهه حاضر بود و هرگز از گلوله و شهادت نمی‌هراسید. 

این رهبر شما به ریاست‌جمهوری رسید. مولوی گل‌محمد در خانه او بود. تعریف می‌کرد که ده روز مهمانش بودم، حتی چای هم نیاوردند. به او گفتند؛ چون از کوپن استفاده می‌کنیم چای و قندمان تمام شده! ایشان هیچ‌وقت هم به رخ کسی نکشید زهدش را. بیرون که می‌آید زیباترین لباس و عبا را می‌پوشد؛ مجلّل، پاک، تمیز و مرتب می‌آید؛ اما در خلوت، زهد دارد.

آیت الله حائری شیرازی(ره)

علی لاریجانی:

ما در طول جنگ 12 روزه اسراییل علیه ایران، جلساتی هم داشتیم، نظراتمان را هم مستمرّاً برای ایشان ارسال می‌کردیم، بازخوردش هم به ما می‌رسید و کاملاً مشهود بود؛ الان هم که بعد از جنگ، ارتباطات ما بیشتر است. ایشان در راهشان خیلی بااطمینان گام برمی‌دارند و این رفتارشان خیلی شبیه به امام است.

شهید مطهری وقتی امام را در پاریس دیده بودند، فرمودند که ایشان چهار «آمَنَ» داشت: آمِن به هدف، آمِن به راه، آمِن به ملّت، آمِن به خدا.

 آیت‌ الله لطف‌ الله صافی گلپایگانی می فرمود:

 بنده در تمام ملاقات‌های خصوصی با مسئولان و ائمه‌ جمعه سفارش می‌‌كنم كه تقویت آیت‌ الله خامنه‌ای، تقویت نظام و انقلاب است؛ خداوند را شُكر كنید كه ایشان در تمام مسائل و خطر‌ها پیش‌گام بوده‌اند و واقعاً ناخدای خوبی در این دریای توفان‌زده هستند.

 ما چه حكومتی را بپذیریم كه در رأس آن، مثل آقای خامنه‌ای را پیدا كنیم؟ كی بهتر از ایشان است كه با تمام وجود مقابل دنیای زورگو و بی‌منطق ایستاده، و دنیا هم از ایشان حساب می‌‌برد؟ ما باید به ایشان كمك كنیم.

یکی از اسناد ساواک که ارتباط مقام معظم رهبری را با نسل جوان مورد تاکید قرار می‌دهد، سند شماره 3003/9 به تاریخ 8/1/1353 است که می‌نویسد: مطهری از اینکه نماز جماعت سیدعلی خامنه‌ای در مشهد (توسط ساواک) تعطیل شده، ابراز ناراحتی کرده و گفته است: سید علی خامنه‌ای از نمونه‌های ارزنده‌ای است که برای آینده موجب امیدواری است و در این مدت کوتاه در مشهد کارهای پرثمری انجام داده که یکی از آن‌ها جمع کردن جوانان روشنفکر حوزه و دانشگاه است.

سلاله الابرار، ص 88، به نقل از اسناد ساواک، آرشیو وزارت اطلاعات، ش 27؛ به ارزیابی 573 مرکز اسناد انقلاب اسلامی