زمانی برای امضای قائم‌مقامی رهبری، خدمت حضرت آیت‌الله بهاءالدینی می‌رسند، ایشان امضا نمی‌کنند. هر چه از فرستادگان آقای منتظری اصرار، از ایشان انکار، تا آنجا که خود آقای منتظری، شخصا خدمت ایشان می‌رسد و تمام کتاب‌هایی را که درباره ولایت‌فقیه نوشته است، جلوی روی آقای بهاءالدینی می‌چیند. آیت‌الله بهاءالدینی تمام کتب را جمع می‌کنند و به آقای منتظری می‌گویند: 

«ولایت‌فقیه، نوشتنی نیست؛ فهمیدنی است». 

بعد که از ایشان می‌پرسند: آقا چرا او را تأیید نکردید، مگر شخص دیگری هم می‌تواند؟ 

می‌فرمایند: «نظر ما سیدعلی خامنه‌ای است.» 

آقای بهاءالدینی فرموده است: «البته هیچ‌کس حاج‌آقا روح‌الله نمی‌شود؛ ولی آقا سیدعلی خامنه‌ای، حقیقت ولایت‌فقیه هستند و رهبر...»

 (کتاب جلوه آفتاب، علی احمدی‌خواه)